Esistono poche segnalazioni di possibilità di guarigione con monitoraggio medico conservativo, rigorosa igiene locale e rimozione del portale dalle perforazioni nella fossa glutea. In caso di sviluppo di infiammazione iniziale (senza ascesso), questa può essere trattata con antibiotici.

L'infiammazione pilonidale può, tuttavia, portare alla formazione di una cavità purulenta (ascesso), accompagnata da gonfiore locale e dolore intenso che si sviluppano entro poche ore o giorni. La formazione di un ascesso richiede un drenaggio chirurgico urgente della tasca purulenta e, di solito, un ulteriore trattamento chirurgico, una volta che l'infiammazione acuta si è attenuata.

Il trattamento chirurgico è la soluzione più comune in tutto il mondo per chi soffre di pilonide cronica (persistente).

Sono note decine di metodi di trattamento e chirurgici per il seno pilonidale, che possono essere classificati in due forme fondamentali di trattamento:

1. Interventi chirurgici in cui viene eseguita un'ampia escissione del tessuto nella fossa glutea. (Dettagli nella pagina "Escissione ampia").

2. Trattamenti senza escissione tissutale o con escissione tissutale minima .( Dettagli nella pagina "Trattamenti minimi").